北京民辦教育協會的最高權力機構是會員代表大會。理事會是會員代表大會的執行機構，在會員代表大會閉會期間領導協會開展日常工作，對會員代表大會負責。協會設立常務理事會。常務理事會由理事會選舉産生，在理事會閉會期間行使理事會職權並對理事會負責。協會的日常辦事機構爲秘書處。

北京民辦教育協會第三屆理事會

会    长：刘  林
執行會長：吳鳳臣
副 会 长：王万良  余  临  周孟奎  焦福岩  林一鸣  周  宏  平桂祥  李  罡  周延波

         俞敏洪  王志泽  尹  雄  樊保国  张仕友  马学雷  王广发  陈  尧  朱  燕  

         姚  炜  史燕来  张连海  欧  蓬  李永新  施  华  李  杰  
秘 书 长：贾咏梅
副秘书长：程  琳  段玉厂  张  冲

北京民辦教育協會第三屆監事會

监 事 长：张杰庭
副監事長：周海濤